Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rbm27Q5SFM8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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