Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Trappc1Q5NCF2 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Trappc1Q5NCF2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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