Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmub2Q3V209 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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