Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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