Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms