Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp30Q3UN04 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp30Q3UN04 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp30Q3UN04 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp30Q3UN04 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usp30Q3UN04 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usp30Q3UN04 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usp30Q3UN04 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp30Q3UN04 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usp30Q3UN04 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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