Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 1700063D05Rik-204ENSMUST00000213914 1007 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms