Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kdm4dQ3U2K5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kdm4dQ3U2K5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kdm4dQ3U2K5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kdm4dQ3U2K5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Kdm4dQ3U2K5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Kdm4dQ3U2K5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Kdm4dQ3U2K5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Kdm4dQ3U2K5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Kdm4dQ3U2K5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Kdm4dQ3U2K5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Kdm4dQ3U2K5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms