Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms