Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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