Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc27Q3TKY6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms