Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prr27Q3SYJ2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms