Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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