Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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