Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Calb2Q08331 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms