Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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