Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb5Q02739 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb5Q02739 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms