Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grin2cQ01098 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms