Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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