Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms