Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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