Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Acta1P68134 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms