Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2iP60898 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2iP60898 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2iP60898 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2iP60898 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2iP60898 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr2iP60898 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms