Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Dpf3P58269 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dpf3P58269 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dpf3P58269 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dpf3P58269 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dpf3P58269 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dpf3P58269 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dpf3P58269 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dpf3P58269 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dpf3P58269 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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