Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb3P54754 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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