Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VhlP40338 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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