Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtlP38585 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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TtlP38585 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TtlP38585 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtlP38585 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtlP38585 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtlP38585 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtlP38585 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
TtlP38585 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtlP38585 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtlP38585 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TtlP38585 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms