Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms