Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nedd1P33215 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms