Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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