Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TP20293 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TP20293 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TP20293 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TP20293 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TP20293 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TP20293 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TP20293 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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TP20293 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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TP20293 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TP20293 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TP20293 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms