Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P20040 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P20040 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P20040 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms