Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms