Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb1P09055 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms