Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P04212 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P04212 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P04212 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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