Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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