Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffaO54786 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DffaO54786 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffaO54786 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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