Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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Foxd2O35392 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Foxd2O35392 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Foxd2O35392 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Foxd2O35392 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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Foxd2O35392 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Foxd2O35392 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Foxd2O35392 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Foxd2O35392 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Foxd2O35392 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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Foxd2O35392 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxd2O35392 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms