Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Slc18a3O35304 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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