Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fpr-s1O08790 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms