Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm8888J3QPX5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm8888J3QPX5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms