Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm933J3QPC1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm933J3QPC1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms