Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms