Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms