Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Srp72F8VQC1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Srp72F8VQC1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms