Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kif28pD3YXS5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms