Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rd3lB2RV38 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms