Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms