Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms