Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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